Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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