Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rrp8Q9DB85 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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