Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9D4W2 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D4W2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms