Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Use1Q9CQ56 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Use1Q9CQ56 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Use1Q9CQ56 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Use1Q9CQ56 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Use1Q9CQ56 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Use1Q9CQ56 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Use1Q9CQ56 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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