Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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