Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms