Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Rdh13Q8CEE7 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms