Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc17Q8CE13 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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