Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccdc187Q8C5V8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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