Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp40Q8BWR4 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms