Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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