Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Rpl6-201ENSMUST00000031617 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Gm20809-201ENSMUST00000179663 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Gm20806-201ENSMUST00000180324 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm20909-202ENSMUST00000181205 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Gm20898-201ENSMUST00000185598 693 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm20800-201ENSMUST00000185634 693 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm20902-201ENSMUST00000185643 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm21268-201ENSMUST00000185646 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm21257-201ENSMUST00000185655 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm21733-201ENSMUST00000185670 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm29075-201ENSMUST00000185717 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm20889-201ENSMUST00000185749 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm28273-201ENSMUST00000185811 695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm20799-201ENSMUST00000185833 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm21160-201ENSMUST00000185838 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm21741-201ENSMUST00000185883 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm21922-201ENSMUST00000185911 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm21275-201ENSMUST00000185958 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm20847-201ENSMUST00000186066 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms