Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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