Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp19Q3UJD6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp19Q3UJD6 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp19Q3UJD6 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp19Q3UJD6 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp19Q3UJD6 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp19Q3UJD6 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp19Q3UJD6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp19Q3UJD6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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