Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms