Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf5P56477 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms