Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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PtpreP49446 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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