Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cdc6-201ENSMUST00000092706 4614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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