Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms