Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21976J3QNN2 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms