Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms