Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm4925-201ENSMUST00000092231 397 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mageb2-201ENSMUST00000101397 1143 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm22777-201ENSMUST00000104091 129 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm12738-201ENSMUST00000122349 536 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Cd209b-203ENSMUST00000171635 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm37261-201ENSMUST00000194360 1101 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm33024-201ENSMUST00000203143 633 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 AC093022.2-202ENSMUST00000227500 866 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mageb1-202ENSMUST00000099471 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1491-204ENSMUST00000216366 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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