Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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