Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms