Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms