Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm42589-201ENSMUST00000199097 1751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Platr11-201ENSMUST00000182885 388 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rnf17Q99MV7 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf17Q99MV7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm14264-201ENSMUST00000147141 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf17Q99MV7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf17Q99MV7 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf17Q99MV7 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Mif-201ENSMUST00000038169 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf17Q99MV7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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