Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Gm15423-201ENSMUST00000150600 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Pcsk2os1-202ENSMUST00000156780 527 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Zfp640-201ENSMUST00000071320 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hecw1Q8K4P8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Rps9-205ENSMUST00000126562 896 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hecw1Q8K4P8 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms