Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc12Q8K2L8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms