Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntrobQ8CB62 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms