Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms