Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPS2

Carns1, Carnosine synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carns1Q6ZPS2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Carns1Q6ZPS2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Carns1Q6ZPS2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms