Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms