Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BcanQ61361 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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