Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Trpm1-202ENSMUST00000177102 2928 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 BC030343-201ENSMUST00000199606 2439 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk2-201ENSMUST00000079451 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm31983-202ENSMUST00000210553 3155 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm2os1-201ENSMUST00000161697 1618 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm44753-201ENSMUST00000207739 2335 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms