Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp48Q3V0C5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp48Q3V0C5 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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