Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms