Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 D330050G23Rik-202ENSMUST00000128305 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ankrd33bQ3U0L2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms