Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rpusd2Q149F1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rpusd2Q149F1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rpusd2Q149F1 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rpusd2Q149F1 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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