Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Apoc1-204ENSMUST00000207978 339 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm31698-201ENSMUST00000214227 430 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC154729.1-201ENSMUST00000224481 1501 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 n-R5s90-201ENSMUST00000103968 118 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC123692.1-201ENSMUST00000227514 730 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Prpf38a-201ENSMUST00000079213 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm23368-201ENSMUST00000116939 96 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Etv3l-201ENSMUST00000193196 325 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Taf9b-202ENSMUST00000113495 2512 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC107369.2-201ENSMUST00000226154 916 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 1810009J06Rik-201ENSMUST00000076638 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Fam45a-201ENSMUST00000025957 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Nbr1-201ENSMUST00000071537 3239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm45780-201ENSMUST00000212089 224 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC124173.1-201ENSMUST00000223701 189 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms