Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm2981-201ENSMUST00000213947 694 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm33024-201ENSMUST00000203143 633 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlh1Q02576 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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