Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top2aQ01320 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm12168-201ENSMUST00000119051 368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms