Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pkn1P70268 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkn1P70268 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkn1P70268 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkn1P70268 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkn1P70268 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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