Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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