Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sh3bp1P55194 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms