Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PtpreP49446 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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PtpreP49446 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PtpreP49446 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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