Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm11605-201ENSMUST00000120413 646 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ccdc190-202ENSMUST00000175731 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 2900076A07Rik-207ENSMUST00000181492 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm18822-201ENSMUST00000182857 1025 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm18873-201ENSMUST00000219517 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 AC154706.1-201ENSMUST00000225482 585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Eda2r-202ENSMUST00000113832 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm13005-201ENSMUST00000119518 585 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm13450-201ENSMUST00000121107 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rps9-205ENSMUST00000126562 896 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 9230117E06Rik-201ENSMUST00000159309 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 AC157772.1-201ENSMUST00000226266 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 AC140406.3-201ENSMUST00000227619 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Il18bp-203ENSMUST00000209844 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm24556-201ENSMUST00000104547 130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm26964-201ENSMUST00000182516 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm5150-202ENSMUST00000194367 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm15860-203ENSMUST00000197262 360 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm5037-201ENSMUST00000205327 618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mir187-201ENSMUST00000083598 61 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1P40201 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm11514-201ENSMUST00000117670 432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Rpl7l1-ps1-201ENSMUST00000118822 725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm17084-201ENSMUST00000163843 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1P40201 Shisa5-204ENSMUST00000196954 843 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms