Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tusc5-201ENSMUST00000062024 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Nkd1-202ENSMUST00000169179 4081 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Atp7b-201ENSMUST00000006742 6505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Kif1b-202ENSMUST00000055647 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms