Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm34106-201ENSMUST00000193782 503 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Magea8-201ENSMUST00000070141 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms