Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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