Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms